Michael Jakobi, auch Michael Jacobi (* 1618 in Sanne; † 19. Oktober 1663 in Lüneburg) war ein deutscher Kantor und Kirchenmusiker, der hauptsächlich durch seine musikalische Zusammenarbeit mit Johann Rist (1607–1667) bekannt geworden ist.
Michael Jakobi wurde 1618 im Dorf Sanne nahe Arendsee in der Mark Brandenburg geboren. Sein Vater war lutherischer Pfarrer, seine Mutter eine Pfarrerstochter. Er ging für drei Jahre nach Stockholm, bevor er sich 1641 als Jurastudent in Straßburg immatrikulierte. Zwei Jahre später begann er ein Reiseleben, das ihn durch Frankreich, Italien (Venedig, in erster Linie Soldat (Kavallerie) im Krieg Venedigs gegen den Kirchenstaat, daneben auch Mailand, Padua und Bologna), die Niederlande und Dänemark führte.
Spätestens 1647 begann seine Zusammenarbeit mit dem nur elf Jahre älteren Hamburger Pastor Johann Rist, der ihn einmal seinen »werten und an Sohnes Statt geliebten Freund« nennt; für dessen poetische Werke steuerte er schlichte Liedsätze bei. Auf Rists Empfehlung wurde er 1648 Stadtkantor in Kiel. Dort heiratete er am 16. September 1650 die Kaufmannstochter Katharina Holsten; dem Paar wurden in der Folgezeit acht Kinder geboren.
Ein Urgroßneffe war der Königsberger Bankier und Kant-Freund Johann Conrad Jacobi (1717–1774).
1651 wurde Jakobi – wiederum auf Empfehlung von Rist – Kantor an St. Johannis in Lüneburg. Dieses Amt hatte er bis zu seinem Tode inne. In den zwölf Jahren seiner Wirksamkeit dort kam es zur Reorganisation der kriegsbedingt daniederliegenden vokalen und instrumentalen Schul- und Kirchenmusik. Erstmals in Lüneburg ist für diese Zeit die Aufführung von Passionsoratorien im Karfreitagsgottesdienst bezeugt. Vermutlich stammte die von ihm aufgeführte Figuralmusik, dem Brauch der Zeit entsprechend, überwiegend aus seiner Feder; überliefert sind jedoch nur die Liedsätze für Rist.