1955 wurde Berthier gebeten, Musik für die Communauté Taizé zu komponieren, die damals nur eine monastische Klostergemeinde von zwanzig Brüdern war. Sechs Jahre später wurde er Organist in der Jesuitenkirche Jesuitsin Paris, Saint-Ignace, wo er bis zu seinem Tod arbeitete. 1975 wurde Berthier erneut gebeten, für Taizé zu komponieren, diesmal für die zunehmende Anzahl junger Menschen, die sich dort zu Gebet und Lobpreis trafen. Über fast zwanzig Jahre komponierte Berthier eine sehr verständlichen Kirchenmusik, seine Lieder werden auf der ganzen Welt gesungen.
Er starb 1994 in seinem Haus in Paris.