Siefert war in den Jahren 1607 und 1608 dank eines Stipendiums des Danziger Stadtrates Schüler von Sweelinck in Amsterdam. Nach der Rückkehr wurde er stellvertretender Organist in Danzig. Von 1611 bis 1616 war er Organist zunächst an der altstädtischen Kirche in Königsberg (heute Kaliningrad), anschließend an Warschauer Hofkapelle Sigismunds III. von Polen. Am 23. September 1623 wurde er zum Organisten der Marienkirche Danzig berufen. Siefert versuchte sich gegen seinen Widersacher, den Warschauer Kapellmeister Marco Scacchi, zu behaupten. Beide Komponisten veröffentlichten im Streit mehrere Musiksammlungen. Christoph Bernhard und Andreas Neunhaber waren Schüler bei Siefert.